Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms