Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn1P70268 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn1P70268 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Pkn1P70268 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Pkn1P70268 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Pkn1P70268 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Pkn1P70268 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkn1P70268 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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