Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrig1P70193 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms