Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UbdP63072 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UbdP63072 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms