Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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