Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta2P62737 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta2P62737 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Acta2P62737 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta2P62737 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms