Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms