Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps13P62301 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps13P62301 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms