Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms