Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps18P62270 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps18P62270 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms