Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s1P61967 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s1P61967 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms