Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga11P61622 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga11P61622 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga11P61622 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms