Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Depdc5P61460 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Depdc5P61460 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.3 ms