Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg6P61406 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg6P61406 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg6P61406 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg6P61406 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg6P61406 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg6P61406 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg6P61406 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms