Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl27P61358 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms