Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms