Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf13P61216 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf13P61216 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms