Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snap25P60879 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms