Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms