Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup43P59235 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms