Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms