Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P58686 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P58686 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P58686 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P58686 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P58686 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P58686 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P58686 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P58686 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P58686 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P58686 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P58686 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P58686 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P58686 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P58686 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P58686 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P58686 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P58686 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P58686 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P58686 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P58686 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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