Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms