Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms