Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NcstnP57716 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms