Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms