Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd38P56528 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms