Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cox7bP56393 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms