Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pex2P55098 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms