Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms