Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GemP55041 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GemP55041 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GemP55041 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GemP55041 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GemP55041 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms