Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NrlP54846 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NrlP54846 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NrlP54846 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NrlP54846 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NrlP54846 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NrlP54846 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NrlP54846 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NrlP54846 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NrlP54846 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NrlP54846 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NrlP54846 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NrlP54846 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NrlP54846 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms