Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms