Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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