Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upp1P52624 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp1P52624 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms