Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnfP51944 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnfP51944 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms