Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApodP51910 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApodP51910 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ApodP51910 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApodP51910 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApodP51910 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApodP51910 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApodP51910 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms