Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfP51642 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfP51642 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfP51642 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfP51642 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfP51642 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfP51642 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfP51642 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfP51642 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfP51642 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfP51642 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfP51642 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfP51642 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfP51642 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfP51642 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfP51642 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfP51642 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfP51642 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfP51642 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms