Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TspoP50637 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TspoP50637 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TspoP50637 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TspoP50637 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TspoP50637 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TspoP50637 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TspoP50637 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TspoP50637 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TspoP50637 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TspoP50637 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TspoP50637 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TspoP50637 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TspoP50637 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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