Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms