Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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BckdhaP50136 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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BckdhaP50136 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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BckdhaP50136 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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BckdhaP50136 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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BckdhaP50136 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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BckdhaP50136 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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BckdhaP50136 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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BckdhaP50136 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BckdhaP50136 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BckdhaP50136 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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BckdhaP50136 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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BckdhaP50136 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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