Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod1P49813 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms