Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5P49615 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms