Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpreP49446 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpreP49446 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpreP49446 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms