Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CitP49025 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CitP49025 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CitP49025 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CitP49025 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CitP49025 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CitP49025 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CitP49025 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CitP49025 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CitP49025 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CitP49025 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CitP49025 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CitP49025 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CitP49025 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CitP49025 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CitP49025 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CitP49025 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CitP49025 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CitP49025 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CitP49025 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CitP49025 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CitP49025 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms