Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GdnfP48540 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GdnfP48540 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GdnfP48540 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GdnfP48540 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GdnfP48540 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GdnfP48540 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GdnfP48540 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GdnfP48540 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms