Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Sox2P48432 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms