Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms