Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VdrP48281 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VdrP48281 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VdrP48281 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VdrP48281 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms