Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbx2P48031 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms